防治方法：
1.蔗苗更新：
(1)苗圃用苗，應採自無病新植蔗園。
(2)苗圃應切實定期檢疫（每年4月至採苗前，每半個月巡查一次），凡發病苗圃不得採苗。
2.原料蔗園：
(1)未發病地區：
a.嚴格禁止由病區輸入蔗苗。
b.每年4至7月間巡視蔗園，發現病株應立即拔除，遇有黑穗時，先把黑穗剪下，放置塑膠袋內燒燬。
(2)發病嚴重地區：
a.注意栽培品種，避免種植易感性品種。
b.原料甘蔗園發現有黑穗病時，不得留宿根及採苗。
c.早期清除病株，每年4至7月間定期巡視蔗園，發現病株時立即拔除，遇有黑穗時，先把黑穗剪下，放置塑膠袋內燒燬，對防止再傳播之效果最大。

3.推廣品種之抗感性